公司层面的合同管理侧重对所有项目合同（总包、分包、采购合同、外委、内部合同等等）、公司级合同的综合管理与控制。重点是合同付款的审批、支付。公司层面与项目层面合同管理处理的是同样的业务对象，不同的是管理职责与范围。公司层面需要监控合同的执行过程，通过设置不同的临界值，自动预警。同时通过监控公司所有合同的执行过程，灵活公司的资金使用。具体的合同管理业务见项目层面介绍。

公司层面的费用管理模块功能是抽去汇总各个项目的费用管理数据，进行查询、统计分析，监控各个项目的费用执行状况，同时可以进行多个项目费用数据的横向对比分析。公司与费用相关的职能部门可以在系统平台进行相关业务的处理。通过此模块，与财务系统相关的数据，可以直接导出中间文件，形成财务系统的凭证。